Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL3P58872 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms