Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRKCHP24723 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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