Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms