Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RNF7Q9UBF6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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