Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms