Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

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Length 1,043 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ATP2A3Q93084 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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