Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms