Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB4BP68371 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms