Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJB2P29033 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms