Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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