Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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