Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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