Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP89Q96ST8 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms