Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms