Protein–RNA interactions for Protein: P81408

FAM189B, Protein FAM189B, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM189BP81408 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM189BP81408 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms