Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms