Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms