Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms