Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM228BP0C875 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms