Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms