Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFAP20Q9Y6A4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms