Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX10Q9Y5X0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms