Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms