Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms