Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SARDHQ9UL12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARDHQ9UL12 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms