Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD1Q9UIS9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms