Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX25Q9UHL0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX25Q9UHL0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms