Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA9Q9UGM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA9Q9UGM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA9Q9UGM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA9Q9UGM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA9Q9UGM1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms