Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRR3Q9UBC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms