Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE4AQ9NXX6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSMCE4AQ9NXX6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms