Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CWC25Q9NXE8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC25Q9NXE8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 495.5 ms