Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms