Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM248Q9NWD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM248Q9NWD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms