Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP5S1Q9NUS5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5S1Q9NUS5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms