Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD3Q9NPG1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms