Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRM3Q9NNZ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRM3Q9NNZ6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms