Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
C6orf50Q9HD87 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C6orf50Q9HD87 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms