Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC4Q9HBW1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4Q9HBW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms