Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms