Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP44Q9H0E7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms