Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDEM3Q9BZQ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms