Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSCC1Q9BVC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSCC1Q9BVC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSCC1Q9BVC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSCC1Q9BVC3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms