Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20AQ96MK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms