Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC35E1Q96K37 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC35E1Q96K37 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms