Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A3Q96GZ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A3Q96GZ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms