Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDXPQ96GD0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms