Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BICD1Q96G01 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BICD1Q96G01 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BICD1Q96G01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms