Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRN2Q92932 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2Q92932 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms