Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PUM2Q8TB72 CDKN1B-203ENST00000442489 577 ntTSL 515.34■□□□□ 0.052e-13■■■■■ 47.8
PUM2Q8TB72 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-25■■■■■ 47.8
PUM2Q8TB72 UCK2-202ENST00000462329 830 ntTSL 1 (best)7.52□□□□□ -1.212e-25■■■■■ 47.8
PUM2Q8TB72 UCK2-203ENST00000463772 599 ntTSL 55.84□□□□□ -1.472e-25■■■■■ 47.8
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PUM2Q8TB72 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 47.8
PUM2Q8TB72 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 47.8
PUM2Q8TB72 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 47.8
PUM2Q8TB72 PPP1R26-203ENST00000602993 409 ntTSL 411.54□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 47.8
PUM2Q8TB72 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.648e-12■■■■■ 47.7
PUM2Q8TB72 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.753e-9■■■■■ 47.7
PUM2Q8TB72 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 47.7
PUM2Q8TB72 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.583e-84■■■■■ 47.6
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PUM2Q8TB72 SKA2-204ENST00000578519 894 ntTSL 310.64□□□□□ -0.714e-17■■■■■ 47.6
PUM2Q8TB72 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.144e-17■■■■■ 47.6
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PUM2Q8TB72 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 511.07□□□□□ -0.641e-323■■■■■ 47.6
PUM2Q8TB72 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-323■■■■■ 47.6
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PUM2Q8TB72 IST1-202ENST00000378798 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-323■■■■■ 47.6
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PUM2Q8TB72 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.131e-323■■■■■ 47.6
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PUM2Q8TB72 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 47.6
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PUM2Q8TB72 MAN1A2-203ENST00000422329 487 ntTSL 26.96□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 47.6
PUM2Q8TB72 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 47.5
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PUM2Q8TB72 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 47.4
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PUM2Q8TB72 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.149e-7■■■■■ 47.4
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PUM2Q8TB72 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.766e-11■■■■■ 47.4
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PUM2Q8TB72 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.666e-11■■■■■ 47.4
PUM2Q8TB72 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.72e-15■■■■■ 47.4
PUM2Q8TB72 CTCF-203ENST00000566078 1627 ntTSL 229.07■■■□□ 2.249e-10■■■■■ 47.4
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PUM2Q8TB72 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.359e-10■■■■■ 47.4
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PUM2Q8TB72 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-11■■■■■ 47.3
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PUM2Q8TB72 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.364e-9■■■■■ 47.1
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PUM2Q8TB72 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 47.1
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PUM2Q8TB72 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.124e-9■■■■■ 47.1
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PUM2Q8TB72 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PCCA-215ENST00000637657 2118 ntTSL 512.56□□□□□ -0.44e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.454e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PCCA-206ENST00000428969 602 ntTSL 311.54□□□□□ -0.564e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.583e-13■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 TBC1D15-217ENST00000550746 6184 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.833e-13■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PCCA-208ENST00000458283 669 ntTSL 39.66□□□□□ -0.864e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PCCA-211ENST00000636366 1654 ntTSL 59.61□□□□□ -0.874e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PCCA-213ENST00000636475 1971 ntTSL 59.61□□□□□ -0.874e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.893e-13■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.084e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 COCH-211ENST00000557065 654 ntTSL 57.35□□□□□ -1.234e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 HACE1-206ENST00000517995 2809 ntTSL 1 (best)6.21□□□□□ -1.423e-17■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 EIF4ENIF1-210ENST00000445424 861 ntTSL 25.38□□□□□ -1.554e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.834e-9■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 HACE1-203ENST00000369127 5318 ntTSL 1 (best)3.15□□□□□ -1.913e-17■■■■■ 47.1
PUM2Q8TB72 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.542e-11■■■■■ 47.1
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