RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 NISCHQ9Y2I1 1504 aa7.8□□□□□ -1.16
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-203ENST00000419445 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-203ENST00000419445 CHIC1Q5VXU3 224 aa6.39□□□□□ -1.39
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC9O60706 1549 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-203ENST00000419445 HRCP23327 699 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-203ENST00000419445 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-203ENST00000419445 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-203ENST00000419445 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.1□□□□□ -1.43
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.09□□□□□ -1.43
PGGT1B-203ENST00000419445 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-203ENST00000419445 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-203ENST00000419445 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-203ENST00000419445 SCRIBQ14160 1630 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1B-203ENST00000419445 NACADO15069 1562 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-203ENST00000419445 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF8L2P0C7V8 631 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
PGGT1B-203ENST00000419445 WIZO95785 1651 aa5.95□□□□□ -1.46
PGGT1B-203ENST00000419445 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
PGGT1B-203ENST00000419445 SMARCA2P51531 1590 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-203ENST00000419445 PEG3Q9GZU2 1588 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-203ENST00000419445 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC88BA6NC98 1476 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-203ENST00000419445 BICRAQ9NZM4 1560 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-203ENST00000419445 SMARCA4P51532 1647 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM41Q8WV44 630 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC8Q09428 1581 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-203ENST00000419445 SOGA1O94964 1423 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-203ENST00000419445 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC13AQ9UPW8 1703 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-203ENST00000419445 TNIKQ9UKE5 1360 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP162Q5TB80 1403 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-203ENST00000419445 EEA1Q15075 1411 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNJ1O43426 1573 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-203ENST00000419445 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF21BO75037 1637 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1B-203ENST00000419445 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1B-203ENST00000419445 PRXQ9BXM0 1461 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-203ENST00000419445 CSRNP3Q8WYN3 585 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-203ENST00000419445 CLIP1P30622 1438 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA3Q08378 1498 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS8Q8N3P4 1428 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 NEUROD1Q13562 356 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 CUX2O14529 1486 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 TOP2BQ02880 1626 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP164Q9UPV0 1460 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 ERICH3Q5RHP9 1530 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 NCAPD3P42695 1498 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-203ENST00000419445 ARAP1Q96P48 1450 aa5.65□□□□□ -1.51
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGXB3Q12766 1538 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-203ENST00000419445 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-203ENST00000419445 CFTRP13569 1480 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-203ENST00000419445 CUX1P39880 1505 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-203ENST00000419445 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-203ENST00000419445 EHMT2Q96KQ7 1210 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPKBP1O60336 1514 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K1Q13233 1512 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 IGF1RP08069 1367 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 MIER1Q8N108 512 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 TIAM1Q13009 1591 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF27Q86VH2 1401 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNB3Q8WWL7 1395 aa5.47□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa5.47□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 CADPSQ9ULU8 1353 aa5.47□□□□□ -1.53
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa5.46□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.46□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF11O15085 1522 aa5.46□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRKQ15262 1439 aa5.45□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 FGD5Q6ZNL6 1462 aa5.45□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.44□□□□□ -1.54
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